Deep learning representations to support COVID-19 diagnosis on CT slices / Representaciones basadas en aprendizaje profundo como apoyo del diagnóstico de la COVID-19 en cortes de tomografía computarizada

Introduction: The coronavirus disease 2019 (COVID-19) has become a significant public health problem worldwide. In this context, CT-scan automatic analysis has emerged as a COVID-19 complementary diagnosis tool allowing for radiological finding characterization, patient categorization, and disease follow-up. However, this analysis depends on the radiologist's expertise, which may result in subjective evaluations. Objective: To explore deep learning representations, trained from thoracic CT-slices, to automatically distinguish COVID-19 disease from control samples. Materials and methods: Two datasets were used: SARS-CoV-2 CT Scan (Set-1) and FOSCAL clinic's dataset (Set-2). The deep representations took advantage of supervised learning models previously trained on the natural image domain, which were adjusted following a transfer learning scheme. The deep classification was carried out: (a) via an end-to-end deep learning approach and (b) via random forest and support vector machine classifiers by feeding the deep representation embedding vectors into these classifiers. Results: The end-to-end classification achieved an average accuracy of 92.33% (89.70% precision) for Set-1 and 96.99% (96.62% precision) for Set-2. The deep feature embedding with a support vector machine achieved an average accuracy of 91.40% (95.77% precision) and 96.00% (94.74% precision) for Set-1 and Set-2, respectively. Conclusion: Deep representations have achieved outstanding performance in the identification of COVID-19 cases on CT scans demonstrating good characterization of the COVID-19 radiological patterns. These representations could potentially support the COVID-19 diagnosis in clinical settings.

Introducción. La enfermedad por coronavirus (COVID-19) es actualmente el principal problema de salud pública en el mundo. En este contexto, el análisis automático de tomografías computarizadas (TC) surge como una herramienta diagnóstica complementaria que permite caracterizar hallazgos radiológicos, y categorizar y hacer el seguimiento de pacientes con COVID-19. Sin embargo, este análisis depende de la experiencia de los radiólogos, por lo que las valoraciones pueden ser subjetivas. Objetivo. Explorar representaciones de aprendizaje profundo entrenadas con cortes de TC torácica para diferenciar automáticamente entre los casos de COVID-19 y personas no infectadas. Materiales y métodos. Se usaron dos conjuntos de datos de TC: de SARS-CoV-2 CT (conjunto 1) y de la clínica FOSCAL (conjunto 2). Los modelos de aprendizaje supervisados y previamente entrenados en imágenes naturales, se ajustaron usando aprendizaje por transferencia. La clasificación se llevó a cabo mediante aprendizaje de extremo a extremo y clasificadores tales como los árboles de decisiones y las máquinas de soporte vectorial, alimentados por la representación profunda previamente aprendida. Resultados. El enfoque de extremo a extremo alcanzó una exactitud promedio de 92,33 % (89,70 % de precisión) para el conjunto 1 y de 96,99 % (96,62 % de precisión) para el conjunto-2. La máquina de soporte vectorial alcanzó una exactitud promedio de 91,40 % (precisión del 95,77 %) para el conjunto-1 y del 96,00 % (precisión del 94,74 %) para el conjunto 2. Conclusión. Las representaciones profundas lograron resultados sobresalientes al caracterizar patrones radiológicos usados en la detección de casos de COVID-19 a partir de estudios de TC y demostraron ser una potencial herramienta de apoyo del diagnóstico.

Hallazgos histopatológicos pulmonares en COVID-19. Experiencia de autopsias mínimamente invasivas / Pulmonary histopathological findings in Covid-19 patients: based on minimally invasive autopsies

Introducción: la COVID-19 es causada por el virus SARS-CoV-2. La presentación clínica varía desde pacientes asintomáticos hasta manifestaciones severas. Durante la pandemia se han realizado autopsias que han permitido reconocer los cambios en diferentes órganos, siendo el pulmón el más afectado. El objetivo del presente estudio es informar nuestra experiencia en cuanto a los hallazgos histopatológicos pulmonares, mediante el sistema de autopsia mínimamente invasiva. Metodología: se tomaron muestras a 8 pacientes fallecidos por COVID-19 en la unidad de cuidado intensivo (UCI) confirmado por PCR en el Hospital de San José, Bogotá, Colombia, en la primera hora después de la muerte. Los tejidos fueron analizados por dos patólogos en forma independiente. Resultados: se observó en todos daño alveolar difuso (DAD) en fases exudativa, proliferativa o ambas, además de bronconeumonía y neumonitis intersticial. Discusión: el pulmón es el principal órgano afectado por el SARS-CoV-2 y el hallazgo histopatológico más frecuente es el DAD en fases exudativa y mixta. También se han descrito alteraciones en diferentes sistemas. Conclusiones: el hallazgo histopatológico pulmonar más frecuente es el DAD en diferentes estadios. Se considera que la autopsia mínimamente invasiva es de gran utilidad en escenarios donde la convencional se encuentra limitada, pues no presenta grandes restricciones y permite obtener tejidos viables.

Introduction: COVID-19 is caused by the SARS-CoV-2 virus. Its clinical presentation varies from asymptomatic patients to severe manifestations. During the pandemic, autopsies have allowed the recognition of changes in different organs, with the lung being the main affected organ. The aim of this study is reporting our experience derived from pulmonary histopathological findings, based on the minimally invasive autopsy method. Methodology: samples were taken in the immediate postmortem (one hour) period from 8 patients who died with PCR-confirmed COVID-19, in the intensive care unit (ICU) of Hospital de San José, Bogotá, Colombia. Tissue specimens were analyzed independently by two pathologists. Results: all specimens exhibited, diffuse alveolar damage (DAD) in exudative or proliferative phases, or both, in addition to bronchopneumonia and interstitial pneumonitis. Discussion: the lung is the main organ affected by SARS-CoV-2 and the most frequent histopathologic finding is exudative phase or various phases DAD. Alterations in different systems have also been described. Conclusions: the most frequent histopathological finding is DAD in any of its phases. Minimally invasive autopsy is considered a very useful alternative when conventional autopsy cannot be performed, since it does not have major restrictions and allows collecting viable samples.

Estrategias de flexibilidad y su relación con el ambiente laboral, la dedicación y el reto intelectual / Flexibility strategies and their relationship with workplace environment, dedication and intellectual challenge

Resumen Las empresas han integrado estrategias de flexibilidad como parte importante en los procesos de recursos humanos, principalmente como un componente más de su salario emocional. El objetivo de esta investigación fue establecer de qué manera la flexibilidad laboral se relaciona con la dedicación, el reto intelectual y el ambiente laboral que perciben las personas en su lugar de trabajo. Se realizó una investigación de tipo cuantitativo durante el mes de noviembre de 2018, en el que se aplicó un cuestionario en línea de 38 reactivos, obteniendo una muestra de 282 trabajadores mexicanos de la ciudad de Monterrey, Nuevo León, México. El 95.4 % de los entrevistados manifestaron interés por al menos una de las variantes de trabajo flexible. La modalidad de trabajo en espacios abiertos fue la opción menos aceptada, con una preferencia del 7.8 %. Se encontró correlación positiva entre el ambiente laboral y el balance positivo por trabajo flexible. El ambiente laboral también mostró alta correlación positiva con la dedicación y el reto intelectual. Lo anterior resulta de interés en el contexto actual para las estrategias de recursos humanos y el ambiente empresarial.

Abstract Currently, there are many companies in the world that have been integrating flexibility strategies as an important part in the human resources processes, mainly as an additional component of their emotional salary. The aim of this research is to understand the correlation between job flexibility and dedication, intellectual challenge and the work environment that people perceive in their workplace. A quantitative research was carried out during November 2018. An online questionnaire of 38 items was administered to a sample of 282 Mexican workers from the city of Monterrey, Nuevo León in Mexico. Findings indicate that 95.4 % of interviewees showed an interest for at least one of the flexible work variants. The open space work modality was the least desirable with a 7.8 % preference. A positive correlation between work environment and a positive balance due to flexible work was found. The working environment similarly showed a high positive correlation with dedication and intellectual challenge. The foregoing findings are of interest to the current context for human resource strategies and the business environment.

Patología y salud pública: Oportunidades para el avance / Pathology and public health: opportunities for progress

La patología y la salud pública son disciplinas que se complementan en múltiples formas, desde la información que aportan mutuamente a niveles individual y poblacional, hasta la elaboración de políticas públicas en salud y la gestión de la información en los biobancos, así como la articulación para respuesta en emergencias y brotes. En revisión no sistemática resaltamos que los dos campos de mayor colaboración con la salud pública son la patología forense (comprendiendo muertes violentas y no violentas) y la patología molecular, realizando aportes significativos a la planeación de los servicios de salud, la calidad de la información epidemiológica, la salud pública basada en la evidencia que permite una mejor toma de decisiones, y la gestión de la salud comunitaria y poblacional. A partir de la revisión realizada se identificaron como puntos de mejora el uso de los sistemas de información, la necesidad de un enfoque interdisciplinario más tangible, y la urgente transformación educativa que subyace a esta colaboración.

Pathology and public health are disciplines that complement each other in many ways, from the information they provide to each other at the individual and population levels, to the development of public health policies and the management of information in biobanks, as well as articulation in responding to emergencies and outbreaks. Our non-systematic review highlights that the two most relevant fields which collaborate with public health are forensic pathology (including violent and non-violent deaths) and molecular pathology, making significant contributions to health care planning, the quality of epidemiological information, evidence-based public health that enables better decision-making, and community and population health management. This review identified the use of information systems, the need for a more tangible interdisciplinary approach, and the urgent educational transformation that underlies this collaboration, as areas for improvement.

Características y factores de riesgo de la infección de vías urinarias con cultivo positivo para betalactamasas de espectro extendido en adultos atendidos en urgencias en el Hospital Militar Central / Clinical characteristics and risk factors for urinary tract infection with extended spectrum betalactamase infections in the emergency service of the Central Military Hospital

Objetivo: El objetivo del estudio fue describir los factores de riesgo de los pacientes adultos con infección de vías urinarias (IVU) por enterobacterias productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en la población usuaria del Hospital Militar Central (HMC) los años 2012 y 2014. Se analizaron factores de riesgo como hospitalización previa, residente en unidad de cuidado crónico, uso previo de antibióticos, uso previo de esteroides, instrumentación del tracto urinario y usuario de sonda vesical. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de casos y controles, retrospectivo, la fuente de información fueron las historias clínicas de los pacientes adultos mayores de 18 años de edad, que consultaron al servicio de urgencias del HMC, con diagnostico de IVU por una enterobacteria productora de BLEE. Se establecieron las características de la muestra y se determinó cuales fueron los factores de riesgo asociados al desarrollo de la infección por gérmenes productores de BLEE en la muestra seleccionada. Resultados: De los 1986 aislamientos que cumplían los criterios de selección, 14% correspondían a microorganismos productores de BLEE. De los seis factores de riesgo estudiados, tres presentaron una diferencia estadísticamente significativa: la hospitalización previa, el uso previo de antibióticos y la instrumentación del tracto urinario. De los factores de riesgo identificados, se realizó un análisis multivariado donde se mantuvieron como factores de riesgo significativos el uso previo de antibióticos y la instrumentación del tracto urinario que aumentan el riesgo de IVU por gérmenes productores de BLEE en 1,9 y 3,18 veces respectivamente. Conclusiones: Si bien los otros factores de riesgo descritos no alcanzaron una diferencia estadísticamente significativa, se deben realizar estudios prospectivos para poder evaluar su asociación con el desarrollo de infecciones por gérmenes resistentes y así desarrollar una escala de riesgo que permita al personal de urgencias administrar antibioticoterapia dirigida para este subgrupo poblacional.

Objectives: The objective of the study was to describe the risk factors of adult patients with urinary tract infection (UTI) with extended spectrum beta-lactamase producing bacteria (ESBL) in the population of the Hospital Militar Central (HMC) in 2012 and 2014. Risk factors such as previous hospitalization, chronic care unit resident, previous use of antibiotics, previous use of steroids, urinary tract instrumentation and bladder catheter were analyzed. Material and methods: We conducted a retrospective case-control study, the source of information were the medical records of adult patients older than 18 years of age, who consulted the emergency department of the HMC, diagnosed with UTI by a bacterium carrying ESBL. The characteristics of the sample were established and the risk factors associated with the development of infection by ESBL-producing bacteria in the selected sample were determined. Results: Of the 1986 isolates that fulfilled the selection criteria, 14% reported microorganisms producing ESBL. Of the six risk factors studied, three presented a statistically significant difference: previous hospitalization, previous use of antibiotics and urinary tract instrumentation. Of the risk factors identified, a multivariate analysis was performed in which the previous use of antibiotics and urinary tract instrumentation were maintained as significant risk factors that increase the risk of UTI by ESBL-producing bacterias in 1,9 and 3,18 times respectively. Conclusions: Although the other risk factors described did not reach a statistically significant difference, prospective studies should be performed to assess their association with the development of resistant germ infections and to develop a risk scale that allows emergency personnel to administer targeted antibiotic therapy to this population subgroup.

Caracterización de los pacientes con diagnóstico presuntivo de síndrome coronario agudo sin elevación del segmento ST que asisten a un servicio de urgencias / Profile of patients with non-ST elevation acute coronary syndrome that attend an Emergency Department

Resumen El dolor torácico es uno de los principales motivos de consulta al sistema de urgencias, y este es secundario a condiciones como el síndrome coronario agudo entre otras. Para su diagnóstico se requiere no sólo el resultado de la troponina, sino una evaluación clínica completa en la que se tengan en cuenta factores de riesgo cardiovascular, características del dolor y hallazgos electrocardiográficos. La interpretación inadecuada de las troponinas ultrasensibles lleva a que se someta al paciente a riesgos innecesarios a causa de estudios como el cateterismo cardiaco. Se llevó a cabo un estudio de corte trasversal en un hospital de Bogotá, en el que la causa principal de consulta en el servicio de urgencias fue el dolor torácico, y la primera causa de hospitalización en Cardiología el síndrome coronario agudo. Se recolectaron datos de 411 pacientes a quienes se les realizó arteriografía coronaria, la mayoría hombres con factores de riesgo como hipertensión arterial, tabaquismo y un evento coronario previo. Dentro de los estudios paraclínicos, la fracción de eyección promedio estuvo cercana al 50% y sólo en 201 pacientes se encontraron lesiones epicárdicas significativas.De la muestra analizada, el 13% tenía creatinina mayor de 1,5 mg/dl como causa alterna de elevación del biomarcador y 28% tenía disfunción ventricular izquierda de algún grado. La mayoría de los pacientes en quienes no se documentaron lesiones angiográficamente significativas en el cateterismo cardiaco, la troponina no cumplía criterios de positividad con base en el aumento del 20% respecto al valor inicial si este era positivo o de 50% en caso de que el primer valor fuese negativo. Adicionalmente, del grupo de pacientes con enfermedad coronaria angiográficamente significativa fue más frecuente la combinación de tres o más factores de riesgo cardiovascular en presencia de biomarcador positivo.

Abstract Chest pain is one of the main reasons for consulting the Emergency Department, and it is secondary to conditions, such as acute coronary syndrome. For its diagnosis, it not only requires a Troponin result, but also a full clinical evaluation, in which factors like cardiovascular risk have to be taken into account, as well as characteristics of the pain and the findings on the electrocardiogram. The poor interpretation of the ultrasensitive Troponins leads to the patient being subjected to unnecessary risks due to studies such as cardiac catheterisation. A cross-sectional study was conducted in a hospital in Bogota, in which chest pain was the main reason for consulting the Emergency Department, and acute coronary syndrome the first cause of admission to Cardiology. The study included a total of 411 patients on whom a coronary angiography was performed. The majority were males with risk factors such as arterial hypertension, smokers, and with a previous coronary event. Among the para-clinical studies, the mean ejection fraction was around 50%, and significant epicardial lesions were found in only 201 patients.Of the sample analysed, 13% had a creatinine greater than 1.5 mg/dl as an alternative cause of the elevation of the biomarker, and 28% had some degree of left ventricular function. the majority of patients that did not have significant angiographic lesions in the cardiac catheterisation documented, the Troponin did not meet the criteria for being positive, based on an increase of 20% as regards the initial value if this was positive or 50% in the case where the first value was negative. Furthermore, of the patient group with significant angiographic coronary disease, the combination of three or more cardiovascular risk factors was the most frequent in the presence of a positive biomarker.

Osteocondrodisplasia de tipo displasia campomélica / Osteochondrodysplasia of campomelic dysplasia type

La osteocondrodisplasia de tipo displasia campomélica es una alteración del desarrollo esquelético que se presenta de forma autosómica dominante. Se caracteriza por la angulación de las extremidades, junto con otras alteraciones, cardiopulmonares, orofaciales y neurológicas. Las mutaciones estudiadas presentes en el gen SOX9 son responsables de la mayoría de casos de estas alteraciones. Se presenta aquí un caso de displasia campomélica hijo de madre de 22 años con embarazo de 24 semanas.

Campomelic dysplasia (CD) is a type of osteochondrodysplasia or disorder of skeletal development with autosomal dominant inheritance. It is characterized by angulation of the limbs along with cardiopulmonary, orofacial and neurological alterations. Mutations involving the SOX9 gene are responsible for CD in most affected individuals. A case of CD is presented in a boy born at 24 weeks of gestational age to a 22-year-old mother.

Segundo Simposio SDC Proyecto PR-CHAGAS / Second SDC Symposium PR-CHAGAS Project

Para la Sociedad de Cirugía de Bogotá, Hospital de San José, es un honor haber contado con la presencia del doctor Josep Brugada en el marco del Segundo Simposio SDC, muerte súbita cardiovascular, del proyecto PR-Chagas, financiado por Colciencias y organizado en conjunto con docentes de la Fundación Universitaria de Ciencias de la Salud. La enfermedad de Chagas es una de las enfermedades transmitidas por vectores de mayor importancia en salud pública en el país, en especial por las manifestaciones de la fase crónica que afectan al corazón. El vector de la enfermedad es el triatómino, un tipo de insecto hematófago que se encuentra distribuido en diferentes regiones de nuestro país, poniendo en riesgo de padecer la infección a cerca de 8 millones de nuestros compatriotas generando una importante prevalencia de la miocardiopatía chagásica en diversos departamentos, siendo acorde con estadísticas de la Organización Mundial de la Salud que estima en cerca de 10 millones las personas infectadas en el mundo, siendo de ese total entre 700 000 y 1 200 000 los habitantes infectados en Colombia, convirtiéndonos en un importante nicho para el desarrollo de investigaciones acerca de esta enfermedad.

Caracterización clínica de los pacientes con síncope / Clinical profile of patients with syncope

Resumen Introducción: Se hizo una caracterización clínica de los pacientes con síncope en un Hospital Universitario en Bogotá. Objetivo: Describir las características clínicas de los pacientes con síncope que consultaron al Hospital Militar Central en Bogotá en el período 2012-2015, y analizar la contribución de las ayudas diagnósticas y de las escalas EGSYS y OESIL para orientar el diagnóstico etiológico. Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo, de pacientes mayores de 18 años que ingresaron a urgencias del Hospital Militar Central por síncope; se analizaron características clínicas, estudios solicitados y puntajes de las escalas EGSYS y OESIL. Resultados: Se evaluaron 705 historias clínicas, de las cuales 116 fueron excluidas por datos faltantes; la edad promedio fue 58 años y el 46,52% eran mujeres. El 41,6% tenía hipertensión arterial y el 21% enfermedad cardiaca previa. Según el diagnóstico etiológico, 75% fueron clasificados como síncope no cardiaco, 23% como síncope cardiaco y en 2% no se identificó la etiología. El examen más solicitado fue el electrocardiograma (79%), seguido por troponina (63%) y TAC cerebral (58%). Al aplicar las escalas, 60% de los pacientes tuvo un puntaje menor a 3 (EGSYS) y 2 puntos (OESIL), lo que sugería que eran de etiología no cardiogénica/bajo riesgo de mortalidad respectivamente. Conclusiones: La etiología del síncope en la mayoría de los casos fue no cardiaca. El electrocardiograma debe ser solicitado a todos los pacientes con síncope. El uso rutinario de las escalas de riesgo puede contribuir a disminuir la solicitud de estudios no indicados, optimizar el uso de recursos y reducir los días de hospitalización.

Abstract Introduction: A clinical profile was constructed on patients with syncope in a Bogota University Hospital. Objective: To describe the clinical characteristics of patients with syncope that were seen in the Hospital Militar Central in Bogota in the period 2012-2015, as well as to analyse the contribution of diagnostic aids and the Evaluation of Guidelines in Syncope Study (EGSYS) and the Lazio epidemiological syncope Observation (OESIL) scores in order to determine the aetiological diagnosis. Methods: A descriptive observational study was performed on patients over 18 years admitted to the Emergency Department of the Hospital Militar Central due to syncope. An analysis was carried out on the clinical characteristics, examinations requested, and the scores on the EGSYS and OESI L scales. Results: A total of 705 clinical histories were evaluated, of which 116 were excluded due to lack of data. The mean age was 58 years, and 46.52% were women. Arterial hypertension was observed in 41.6%, and 21% had a previous heart disease. According to the aetiological diagnosis, 75% were classified as non-cardiac syncope, 23% as cardiac syncope, and 2% of unknown origin. The most requested examination was the electrocardiogram (79%), followed by troponin (63%), and a computed tomography brain scan (58%). On applying the scales, 60% of the patients had a score of less than 3 (EGSYS) and 2 points (OESIL), which suggested that they were of non-cardiogenic origin/low mortality risk, respectively. Conclusions: The origin of syncope in the majority of cases was non-cardiac. An electrocardiogram must be requested on all patients with syncope. The routine use of risk scales can contribute to reducing the number of non-indicated examinations, as well as optimise the use of resources and reduce hospital stay.

Respuesta fisiológica y molecular de Anadara tuberculosa (Arcoida: Arcidae) al estrés de salinidad / Physiological and molecular response of Anadara tuberculosa (Arcoida: Arcidae) to salinity stress

Resumen: La concha negra Anadara tuberculosa es una especie emblemática del ecosistema manglar que está actualmente en condición vulnerable. El desarrollo de su acuicultura requiere identificar biomarcadores moleculares, en particular asociados al estrés por salinidad en mira al inicio de programas de mejoramiento genético. Se recolectaron ejemplares de Anadara tuberculosa del manglar colindante a la Bahía de Puerto Pizarro (Tumbes, Perú) entre enero 2015 y febrero 2016. Estos individuos fueron sometidos a condiciones de estrés hipo-osmótico (extremo: 5 y 10 ppt); (moderado: 15 y 25 ppt) y sin estrés (grupo control: 33 ppt) por 16 días después de haber sido separados en grupos de diez animales y por triplicado. La presencia de biomarcadores del estrés por salinidad fue evaluada a nivel genético con la detección por PCR de 19 genes reportados como actores claves de la osmorregulación en bivalvos como ostras y mejillones y a nivel proteomico con la secuenciación de péptidos expresados en tejidos de animales expuestos a diferentes salinidades por espectrometría de doble masa. Ninguno de los marcadores genéticos probados pudo ser amplificado por PCR lo que sugiere que A. tuberculosa presente diferencias genéticas significativas en comparación con otros moluscos. El análisis proteómico realizado por MALDI TOF/TOF a nivel de tejido branquial de A. tuberculosa permitió identificar 26 péptidos expresados de formas presenciales y diferenciales a las diferentes salinidades evaluadas, resaltando posibles marcadores como la HSP70 y una proteína transmembrana de transporte de cloruro que están relacionadas con la adaptación a la salinidad. Estas secuencias aminoacídicas permitirán diseñar iniciadores nucleotidicos específicos a A. tuberculosa para la puesta en marcha de futuras investigaciones en ecofisiología de este importante recurso.

Abstract: The pustulose ark A. tuberculosa is an emblematic species of mangrove ecosystem that is currently in a vulnerable condition. The development of its aquaculture, to begin with genetic breeding programs, requires the identification of molecular biomarkers, particularly those associated with salinity stress. With this purpose, specimens of A. tuberculosa were collected from the adjacent mangroves of Puerto Pizarro bay (Tumbes, Perú), from January 2015 to February 2016. Different assays (groups of ten animals in triplicate) were undertaken in separated periods of 16 days: hypo-osmotic stress (extreme: 5, 10 ppt); (Moderate: 15, 25 ppt) and no stress (control group: 33 ppt). The presence of salinity stress biomarkers was assessed at the genetic level throughout PCR detection of 19 genes reported to be key actors in osmoregulation, and at the proteomic level with the sequencing of peptides (tandem mass spectrometry MALDI TOF/TOF), expressed in ark tissues exposed to different salinities. None of the tested genetic markers could be amplified by PCR, suggesting that A. tuberculosa has significant genetic differences compared to other mollusks. Proteomic analysis by mass spectrometry on A. tuberculosa gill tissue, allowed to identify 26 peptides expressed in presential and differential forms at different salinities, highlighting possible markers such as HSP70 and trans-membrane chloride channel transportation protein, to be related with salinity adaptation. These amino acid sequences will allow the design of target specific primers for A. tuberculosa, to implement future research in ecophysiology of this important fishery resource. Rev. Biol. Trop. 65 (3): 1142-1151. Epub 2017 September 01.

Leucoencefalopatía multifocal progresiva asociada al uso de Natalizumab en un paciente con esclerosis múltiple. Primer caso en Latinoamérica. Hospital de San José - Bogotá 2013 / Progressive Multifocal Leukoencephalopathy associated with the use of Natalizumab in Patient with Multiple Sclerosis. First Case Report in Latin America Hospital de San Jose - Bogota, 2013

La Leucoencefalopatía Multifocal Progresiva (LMP) es una condición grave secundaria a la infección por virusJohn Cunningham (VJC) derivada de la deficiencia de inmunidad celular innata o adquirida. Se presenta el primercaso reportado en Latinoamérica de (LMP) asociada a Natalizumab (NZB) en un paciente con diagnóstico deesclerosis múltiple recaída-remisión, quien ingresa a urgencias con cuadro clínico de deterioro cognoscitivo,comportamental, motor y de lenguaje de curso progresivo. Se realizaron neuroimágenes con resonancia magnéticacerebral sugestivas de LMP, estudios de reacción en cadena de polimerasa en líquido cefalorraquídeopara virus JC, que resultaron negativos en dos oportunidades; el diagnóstico se confirmó mediante la técnica dehibridación in situ en biopsia cerebral. Se realiza este reporte con el fin de resaltar la importancia de la vigilanciaclínica y paraclínica en los pacientes con esclerosis múltiple que reciben NZB...

Progressive Multifocal Leukoencephalopathy (PML) is a serious condition secondary to John Cunninghamvirus (JCV) infection derived from an innate or acquired cellular immunity deficiency. We present the firstreported case in Latin America of PML associated with Natalizumab (NZB) in a patient with a diagnostic ofrelapsing – remitting multiple sclerosis, who entered the emergency room with progressive cognitive, behavioral,motor and language impairment. Neuroimaging performed with magnetic resonance imaging was suggestiveof PML. Polymerase chain reactions in cerebrospinal fluid for JC virus were conducted twice with negativeresults. Finally the diagnosis was confirmed by in situ hybridization technique on brain biopsy. This reportis made in order to highlight the importance of clinical and paraclinical monitoring in patients with multiplesclerosis receiving NZB...

Corioamnionitis en biopsia por congelación de placentas en pacientes con riesgo de infección y su relación con morbimortalidad del recién nacido / Histological chorioamnionitis in placental biopsy by frozen section in patients at increased risk of infection and its association with neonatal morbidity and mortality

Se busca determinar si el diagnóstico de corioamnionitis en biopsia por congelación de placenta se relaciona con desenlace desfavorable en el recién nacido. Materiales y métodos: cohorte prospectiva de gestantes con alta sospecha de corioamnionitis a quienes se les practicó biopsia por congelación de cordón y membranas con estudio histopatológico usual, y se relacionó con la morbimortalidad del recién nacido. Resultados: en 23 placentas con sospecha de corioamnionitis se hizo estudio por congelación y parafina; cuatro fueron positivos en ambos y 19 negativos. Cinco desarrollaron sepsis temprana, todos con diagnóstico clínico de corioamnionitis en sus madres, de los cuales tres fueron positivos en ambos estudios microscópicos. Conclusiones: se evaluó la sepsis temprana y la mortalidad en hijos de madres con corioamnionitis diagnosticada mediante biopsias por congelación y parafina, evidenciando una adecuada relación. El diagnóstico por congelación fue preciso y temprano, posicionándose como una posible herramienta diagnóstica que permite un abordaje temprano tanto materno como del neonato con infección potencial, para así disminuir los desenlaces adversos con impacto en la morbimortalidad neonatal...

To determine if histological diagnosis of chorioamnionitis in placental biopsy by frozen section is associated with adverse neonatal outcome. Materials and Methods: prospective cohort study performed in pregnant women with high risk of developing chorioamnionitis associated with neonatal morbidity and mortality. A placental biopsy by frozen section of umbilical cord and membranes was conducted and processed by the usual techniques. Results: placental frozen and paraphin-fixed sections were conducted in 23 patients with clinical suspicion of chorioamnionitis; four were positive in both studies and 19 were negative. Five infants born to women with diagnosed chorioamnionitis developed early-onset sepsis, of which three were positive in both histological studies. Conclusions: early-onset sepsis and mortality was evaluated in neonates of mothers with chorioamnionitis diagnosed by frozen and paraphin-fixed sections, evidencing an adequate relationship. Diagnosis by frozen biopsy section was accurate and timely, and has become a diagnostic tool which allows an early approach both in mothers and infants with potential infection, to reduce adverse outcomes impacting neonatal morbidity and mortality...

Colonización bacteriana post mórtem del líquido cefalorraquídeo: Hospital de San José octubre 2007-octubre 2008 / Bacterial colonization in postmortem-collected cerebrospinal fluid: San José Hospital october 2007-october 2008

Como es un imperativo del Hospital de San José determinar el microorganismo responsable de neuroinfección al momento de la autopsia, es necesario realizar investigaciones que determinen la prevalencia y la frecuencia de la colonización bacteriana; así mismo, es importante identificar los gérmenes bacterianos Gram positivos y negativos en los pacientes fallecidos en la institución. Se realizó este estudio de corte transversal en pacientes hospitalizados mayores de 18 años que fallecieron en el Hospital de San José entre el primero de octubre de 2007 y el primero de octubre de 2008, que cumplieran los criterios de inclusión y exclusión. Se realizó punción transcisternal y toma de muestra de líquido cefalorraquídeo previa autorización de los familiares y se procesó el cultivo estandarizado para gérmenes aerobios Gram positivos y negativos. El estudio fue realizado con 25 pacientes fallecidos en el Hospital de San José, de los cuales el 28% presentaron crecimiento en el cultivo del LCR de muestras aisladas en un tiempo menor de trece horas post mórtem (siete casos).

As identifying the etiologic agent of neurological infection at autopsy is mandatory at the San José Hospital, an investigative procedure to determine the prevalence and frequency of bacterial colonization is required; likewise, it is important to identify gram-positive and gram-negative bacteria in patients who die at the institution. This cross sectional study was conducted in older than 18 year patients who died at said hospital between October 1st, 2007 and October 1st 2008 satisfying the inclusion/ exclusion criteria. After attaining consent from their relatives, a sample of cerebrospinal fluid (CSF) was procured by a Foramen Magnum puncture. Samples were processed using the standard aerobic gram-positive and gram-negative culture techniques. The study was conducted in 25 patients. Growth of bacterial cultures was detected in 28% (7 cases) of the CSF samples isolated at a less than 13-hour post-mortem interval.

Lesiones impalpables del seno: localización mamográfica y biopsia: análisis de 164 anormalidades / Impalpable lesions of the breast: Mammographic localization and biopsy: analysis of 164 abnormalities

La biopsia guiada mediante mamografía en lesiones ocultas del seno es una herramienta útil para el diagnóstico temprano del cáncer y las lesiones premalignas. En esta revisión de 164 pacientes con lesiones no palpables detectadas mediante este procedimiento durante un período de dos años, a quienes se realizó marcación con arpón y resección quirúrgica, se diagnosticó malignidad en 42 pacientes (25,6%), trece de ellas con carcinoma in situ (7,9%) y 29 infiltrante (17,6%). El diagnóstico benigno más frecuente en esta serie fue fibroadenoma, seguido por otras patologías benignas comunes. La categorización mamográfica según el sistema de BI-RADS muestra muy buena correlación con el diagnóstico histopatológico definitivo, evidenciando resultados homologables a otros estudios similares. Por tales hallazgos, nos permitimos recomendar esta técnica de diagnóstico temprano en nuestro medio para lesiones no palpables del seno detectadas con mamografía.

Sistematizacion de expereincias del proyecto TCP/BOL/8821(E) Rehabilitacion de cultivos agricolas en zonas afectadas por la sequia y por el sismo (campaña agricola 1998-1999) / Systematization of experiences of the project TCP/BOL/8821(E) rehabilitation of agricultural cultures in areas affected by the drought and by the earthquake (agricultural campaign 1998-1999)

Tiene el propósito de documentar la experiencia para contribuir a las instituciones involucradas como los municipios afectados, para mejorar la prevision de riesgo en el futuro

Propóleo flebostáticas / Propolis and phlebostatic ulcers

Se realizó un estudio en 30 pacientes con úlceras flebostáticas de los miembros inferiores, en el período comprendido entre abril de 1988 y marzo de 1989, tratados en el Hospital "Freyre de Andrade" dirigido a conocer el efecto cicatrizante de la crema y pincelada de propóleo al 2 % creada en este centro; se comprobó su eficacia como cicatrizante, no así su efecto antibacteriano